Fâris partit avec ceux des Égyptiens qui s’étaient mobilisés à ses côtés, et plaça Kinanah ibn Bishr à la tête de son armée (1). Chaque fois qu’il rencontrait un combattant du Shâm (2), il l’affrontait et le repoussait vaincu jusqu’à l’amener devant ‘Amr ibn al-‘Âs (3). ‘Amr ibn al-‘Âs envoya alors Mu‘âwiya ibn Hudayj pour le prendre à revers, et les gens du Shâm s’avancèrent jusqu’à l’encercler de toutes parts. Kinanah mit pied à terre, récitant : « Et aucune âme ne peut mourir si ce n’est par la permission d’Allah, selon un décret fixé » [Al ‘Imrân, 145], puis il combattit jusqu’à être tué.
Les compagnons de Muhammad ibn Abî Bakr se dispersèrent, le laissant seul. Il s’en alla à pied et aperçut une ruine où il se réfugia. Pendant ce temps, ‘Amr ibn al-‘Âs entra dans la capitale d’Égypte (al-Fusṭâṭ), et Mu‘âwiya ibn Hudayj se lança à la recherche de Muhammad ibn Abî Bakr. En chemin, il croisa des hommes et leur demanda : « Une personne inhabituelle est-elle passée par ici ? » Ils répondirent : « Non. » Mais l’un d’entre eux dit : « J’ai vu un homme assis dans cette ruine. » Il s’écria : « C’est lui, par le Seigneur de la Ka‘ba ! » Ils y entrèrent, le trouvèrent presque mourant de soif et l’en extirpèrent.
Son frère, ‘Abd al-Raḥmân ibn Abî Bakr, alla trouver ‘Amr ibn al-‘Âs – car il était arrivé en Égypte avec lui – et s’écria : « Vas-tu faire exécuter mon frère ? » ‘Amr ibn al-‘Âs envoya alors un message à Mu‘âwiya ibn Hudayj pour qu’il lui amène Muhammad ibn Abî Bakr vivant, mais sans le tuer. Mu‘âwiya répondit : « Non, par Allah ! Vont-ils tuer Kinanah ibn Bishr et je laisserais vivre Muhammad ibn Abî Bakr ? Lui qui fut parmi ceux qui ont tué ‘Uthmân alors qu’il demandait de l’eau… » En effet, Muhammad ibn Abî Bakr leur avait supplié de lui donner ne serait-ce qu’une gorgée d’eau. Mu‘âwiya refusa en disant : « Qu’Allah ne m’abreuve jamais si je te donne une seule goutte ! N’est-ce pas vous qui avez privé ‘Uthmân de l’eau jusqu’à le tuer alors qu’il jeûnait, s’étant déjà consacré à Allah ? Allah l’a reçu avec le nectar scellé. »
Ibn Jarîr (5) et d’autres rapportent que Muhammad (ibn Abî Bakr) se serait montré injurieux envers Mu‘âwiya ibn Hudayj, envers ‘Amr ibn al-‘Âs, envers Mu‘âwiya (ibn Abî Sufyân) ainsi qu’envers ‘Uthmân (ibn ‘Affân), ce qui excita la colère de Mu‘âwiya ibn Hudayj. Il fit avancer Muhammad, le tua, puis plaça son corps dans la dépouille d’un âne qu’il brûla par le feu. Lorsque la nouvelle parvint à ‘Â’isha, elle en fut très affligée et recueillit ses enfants auprès d’elle, dont son fils al-Qâsim, invoquant contre Mu‘âwiya et ‘Amr ibn al-‘Âs à la fin de chacune de ses prières (6).
Al-Wâqidî (7) rapporte qu’‘Amr (ibn al-‘Âs) arriva en Égypte avec quatre mille hommes, parmi lesquels Abû l-A‘war al-Sulamî. Ils affrontèrent les Égyptiens à al-Musannâh (8), livrant de rudes combats, jusqu’à ce que Kinanah ibn Bishr ibn ‘Atâb al-Tujaybî fût tué. Alors Muhammad ibn Abî Bakr s’enfuit et se cacha chez un homme appelé Jabalah ibn Masrûq. Dénoncé, il fut encerclé par Mu‘âwiya ibn Khudayj et ses partisans. Muhammad ibn Abî Bakr sortit vers eux et combattit jusqu’à être tué.